中澳聯(lián)合研究中心是由中澳科學(xué)研究基金支持成立的虛擬中心。在中國科技部和澳大利亞工業(yè)、創(chuàng)新與科技部的指引下，聯(lián)合研究中心連接中澳兩國的研究機構(gòu)，在兩國政府達成共識的重點科技領(lǐng)域開展研究活動。中澳聯(lián)合研究中心為兩國科學(xué)界提供平臺，以壯大研究力量，使研究成果能最大化的轉(zhuǎn)變?yōu)楫a(chǎn)品和商品，從而促進科學(xué)界和產(chǎn)業(yè)界的合作。

 2015年12月宣布的第二輪中澳聯(lián)合研究中心側(cè)重于海洋科學(xué)，食品與農(nóng)業(yè)，采礦設(shè)備、技術(shù)和服務(wù)三個方面。這一輪的項目從2016年開始，到2019年結(jié)束。2016年4月15日，澳大利亞工業(yè)、創(chuàng)新與科技部部長克瑞斯托佛.丕恩正式對外宣布支持6個中心，作為中澳兩個共同應(yīng)對海洋科技、食品、采礦技術(shù)等系列挑戰(zhàn)的重要科技支撐。 六個聯(lián)合中心包括：

· 蘇州大學(xué)和莫納什大學(xué)：研究乳制品在工業(yè)生產(chǎn)過程的效率和新的高價值產(chǎn)品。

· 上海交通大學(xué)和阿德萊德大學(xué)：成立“植物科學(xué)與育種聯(lián)合實驗室”，開發(fā)健康長壽的新谷物。

· 中國農(nóng)業(yè)大學(xué)和墨爾本大學(xué)：針對健康土壤展開合作調(diào)研，以達到糧食作物生產(chǎn)的可持續(xù)發(fā)展。

· 國家海洋局第一海洋研究所和墨爾本大學(xué)：成立“中澳海洋工程研究中心”，開發(fā)新一代的模型來預(yù)測海上氣候。

· 中國科學(xué)院海洋研究所和澳大利亞海洋科學(xué)研究所：中澳近海健康聯(lián)合研究中心。

· 中南大學(xué)和南澳大利亞大學(xué)：研究化學(xué)及礦產(chǎn)傳感，以實現(xiàn)礦產(chǎn)資源處理的可持續(xù)發(fā)展。

其中中澳海洋工程研究中心（Australia-China Center for Maritime Engineering, ACCME）是其中由國家海洋局第一海洋研究所和墨爾本大學(xué)聯(lián)合成立的研究中心，該中心將通過互訪交流、合作培養(yǎng)研究生等方式優(yōu)勢互補、平等合作、共同開展科學(xué)研究，國家海洋局第一海洋研究所所喬方利研究員和墨爾本大學(xué)Alexander Babanin教授擔(dān)任該研究中心的聯(lián)合主任。中澳海洋工程中心作為聯(lián)系中澳兩國海洋科技的紐帶，為兩國海洋科學(xué)界提供平臺，加強兩國海洋領(lǐng)域的實質(zhì)合作、共同應(yīng)對海洋災(zāi)害和氣候變化能力，進而促進科學(xué)界和產(chǎn)業(yè)界的合作。